上述授记中远离诽谤和虚构，非常清楚地预言了地点、人物和时间等，与这殊胜的授记相符合。为了在石门的谷内营建新寺，尊者披挂起了具有殊胜威力慈悲的坚忍的铠甲，以勇猛无比的精进之力，肩负起利乐圣教和众生的神圣职责，将此重任看作是一种装饰后，虽然从龙年（公元１７２４年）开始奠祭动工，但因战火的余烟未息，又拖到羊年（公元１７２７年）重新动工。
   由于石门河谷寺址的地方属于汉地，尊者便用数百两锭银买了下来，在那山谷里把大经堂、佛殿、府邸、僧舍等各个基址尊者亲自规划妥当，还给每个殿堂、拉章、僧舍起了名字。首先盖了些大小不等的石瓦房子，从上下收容了失散的五百多僧人，就在这时候，由于岔口驿的那位汉族官员权高势重，他不让建寺。
   今天砌起来的石屋，明天号令拆掉，明日砌的，后日又拆了。这正像俗语所说的那样：“白日盖殿夜间推，山石全部下平川。”
    正处于这种情况的时候，岔口驿的这位不信佛法的官员离此他往，代兼执事的是一位笃信佛法的汉族官员。尊者给他赠送了良马数匹，白银数秤，并说明了原委。此官道：“我在这里大约住三个月，你们尽量在这期间将佛殿等建成，倘若逾期，那位旧官到来的话，我又要去他处，所以他会如何处理此事就不得而知了。”为此，召集工匠建造佛殿，所有汉藏人员日以继夜地赶修。在该殿内特为皇帝的长寿以及圣教和众生的利益，雕塑起了一尊高大的弥勒佛像。眷属有八大佛子、马头金刚和金刚手菩萨，高度都超过人的身量。另外，周围还塑造石山等景色，非常美观。颜料、镀金和装藏无不俱全，然后举行了隆重的开光典礼。正当名为“喜来嘛”的这座佛殿刚刚落成，初成寺院样式时，那位旧官回来了。他带许多汉兵来寺院，把弥勒佛殿顶上的瓦揭下来扔的时候，尊者双膝跪到那官员面前，把那以千百福德所修来的头颅触及地上，反复顶礼，再三悲求，因此，那汉官才未拆佛殿而归，总算保住了弥勒佛殿。
   那一天，所有的僧侣都无比苦恼和悲伤，说道：“若不是这位圣人特意驾临这里，对我们而言，为圣教和众生所负的担子不知多重？”再说那位汉官当天返回塞堡后，立即九窍流血猝死。人们都说，他承受不住圣人跪拜的缘故。
    这个时候，文殊大皇帝传下了圣旨，原先被年总督（即年羹尧）所毁掉的大小寺院全部退还原主，一律按个人的想法去修复。批复文一道，岳将军（即岳钟琪）将一切寺院重新修复。仰承大皇帝的慈悲，佛法又如日中天般地明亮起来，就像佛教的后弘再现一样。那时藏族的地方又呈现出一片稳定的景象。旨意中也准许石门地方重新修建寺院，各处的寺址上又开始修复寺院了。

   狗年（即公元１７３０年），清军征讨准噶尔时，岳将军邀请尊者到凉州府（也许是兰州，因原文为汉文字音，说不准确），为汉满全体官兵举行佛事活动。为了全歼敌军，数百名骑兵手持兵器排列左右，杀气腾腾，威风凛凛。尊者在这军仪当中作法七日，奉颂战神仪轨，并向敌方抛掷阎摩敌法王的驱魔食子。当时，将军和士兵们向尊者献上了银元等丰厚的酬礼。
    从此开始，又筹建规模宏大的大经堂，数年后竣工。乾隆皇帝在位八年时，僧舍、佛塔，以及本康（装有十万小佛像的小佛殿）等全部建成。用五千两银子从皇帝库中请来了《甘珠尔》和《丹珠尔》经典。修建大经堂花去了银子七千两。另外，长垫、宝盖、幡、幢等一切费用，均由尊者自己出资办了。 
  以尊者为首的二百零五名僧侣的度牒也颁发下来了。原先旧寺里的时候，康熙皇帝赐与尊者为首的六十八人的顶冠及二百零五人的钱粮俸给也得到了恢复，并发放了下来。对尊者俸银三两，其他每个人俸银二两五钱；尊者的俸给净粮三“嘉”（一数量名），其余人为各两“嘉”。因为当时建寺者的名字为“大宝喇嘛”，所以在度牒中也把寺名赐为大宝寺。
    这位尊者上师一心是为了佛法和终生的利益，也为了文殊怙主三界法王宗喀巴大师的清净自宗教法得以护持弘扬广大，更为了文殊大皇帝政教合一的江山社稷繁荣昌盛，仰仗此而生活的汉蒙藏百姓为主的一切有情，为了使他们引置于幸福安乐之处，修起了这座大寺院（原文的“切代钦宝”是大寺院的意思，这就足以证明这时候的石门寺已经规模宏大，形成了一座大寺院）。
   寺中四季的法会和辩经院的规律等皆依西藏哲蚌寺郭芒扎仓的成规执行。密宗方面按拉萨下密宗学院的方式所制定。吉祥佛母等个别仪轨依照顷科杰寺（在西藏山南，公元1509年由第二世达赖喇嘛所创建）的程序如理成立起来了。另外，尤对教法的根本——与戒律有关的清规也作了详细的规定。后来，派遣我（本书的作者拉尊班智达）进藏时，尊者曾修书一封，呈与一切知班禅大师。为了事情之故，直呼尊名，即大堪布罗桑益西仁波切（指班禅大师第五世），并献上其余条款礼物等。班禅大师亲自撰写制定了大法规章程后，又复函尊者并带有事项条款、礼物等。
   总计，石门寺闻思昌盛洲自雍正五年，即羊年（公元1727年）开始营建，到乾隆八年，即猪年（公元1743年），寺院全部告竣（一共用了十六年长的时间才建讫。个别学者的藏汉论文中说1731年完工，这是没有根据的说法，或者是对年限的计算疏虞所致）。
   又在一年，从一个名叫斯木图的地方，得到了一尊普陀观音像。这尊像是中原古响铜所铸，高度等同人身，该像十分沉重，几名壮士也难以抬起。尊者听到以后，派去了几个人迎请。奇怪那尊佛像变得很轻，放到骆驼背上迎请了过来。尊者给佛像擦拭锈斑后进行了合格的装藏，赐奉为石门寺闻思昌盛洲的大经堂内的主像。直到如今，那尊佛像常放光芒，出现彩虹等，显示着非凡的加持力，这些殊胜的瑞兆目前仍然存在。