水热传输过程、山地地表景观及其相互联系以及全球变化下的生态过渡带变化是中科院藏东南高山环境站的主要研究内容。西藏东南部的色季拉山正处在南亚季风携带水热向北传输的通道上，并且成为水热传输通道的第一个高山障碍，水分热量从海拔2500米左右的谷底到5000米左右的山顶发生了巨大的变化，这种变化在全球变化的背景下出现不同的变幅，导致地表温度和降水沿海拔和水热输送路径出现不同组合，并形成不同的生态系统和生态群落。
    2005年夏，藏东南站在色季拉山西侧建立了2个高山林线环境观测场，对阳坡的方枝柏和阴坡的急尖长苞冷杉生长与气候要素的相关关系进行系统观测。在2006年中科院院士咨询团对藏东南站的考察中，建议加强对高山生态过渡带的监测研究。为了了解山地阻隔作用对水热传输的影响及其限制下的植被景观变化，2006秋开始，藏东南站在色季拉山东坡林线附近又架设一台自动气象站，对空气温湿度、大气压、风速风向、太阳总辐射、降雨量、积雪厚度以及土壤温湿度与热通量等多个指标进行自动监测，为了解树木和灌木形成层的活动，林线过渡带上物种组成和群落结构特征的变化等提供必要的气候数据。同时，从海拔3000米左右的谷地到海拔5000米的山顶布设了4组（每组3个）土壤温度／湿度自动数据采集系统，以分析土壤温度、水分变化与生态系统变化的联系。在气象要素与土壤温湿度监测条件的基础上，该站副研究员梁尔源开始在色季拉山东坡方枝柏林线样地上进行了形成层季节活动与树木生长动态的连续观测，与西藏高原生态研究所的专家合作对样地进行了每木检尺与物种分布的调查与树木年轮样本的采集。(编辑 彦榕)