野生动物资源:主要有白唇鹿、马麝、野牛、野驴、岩羊、黄羊、藏羚、雪豹、棕熊、猞猁、旱獭和珍禽黑颈鹤、马鸡、雪鸡等 40余种。鸟类品种居青海省首位,兽类品种居青海省第2位。鹿茸、麝香、熊胆、羚羊角等都是名贵的药材和香料,经济价值极高。
野生植物资源:有野生药用植物冬虫夏草、羌活、柴胡、知母、贝母、沙棘、大黄、秦艽、水母、雪莲、藏茵陈、党参等800余种。其中冬虫夏草年产量在10吨左右。
森林资源:全州现有江西、东仲和扎扎三大原始林区。林地面积为39万公顷,灌木林地面积为29.8万公顷,活立木储量为707万立方米,森林覆盖率为1.7%,林业年产值为100万元。